Protein–RNA interactions for Protein: Q99527

GPER1, G-protein coupled estrogen receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPER1Q99527 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPER1Q99527 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPER1Q99527 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPER1Q99527 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPER1Q99527 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPER1Q99527 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPER1Q99527 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPER1Q99527 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms