Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF2Q99496 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF2Q99496 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF2Q99496 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RNF2Q99496 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RNF2Q99496 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF2Q99496 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF2Q99496 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RNF2Q99496 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF2Q99496 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF2Q99496 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF2Q99496 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF2Q99496 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF2Q99496 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF2Q99496 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF2Q99496 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF2Q99496 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF2Q99496 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF2Q99496 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RNF2Q99496 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RNF2Q99496 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms