Protein–RNA interactions for Protein: Q99426

TBCB, Tubulin-folding cofactor B, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCBQ99426 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBCBQ99426 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TBCBQ99426 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBCBQ99426 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TBCBQ99426 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TBCBQ99426 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TBCBQ99426 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBCBQ99426 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TBCBQ99426 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBCBQ99426 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBCBQ99426 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TBCBQ99426 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TBCBQ99426 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TBCBQ99426 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TBCBQ99426 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TBCBQ99426 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TBCBQ99426 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TBCBQ99426 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBCBQ99426 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TBCBQ99426 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.1 ms