Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NODALQ96S42 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NODALQ96S42 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NODALQ96S42 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NODALQ96S42 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NODALQ96S42 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NODALQ96S42 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NODALQ96S42 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms