Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARXQ96QS3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ARXQ96QS3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARXQ96QS3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ARXQ96QS3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ARXQ96QS3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ARXQ96QS3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ARXQ96QS3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ARXQ96QS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARXQ96QS3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARXQ96QS3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ARXQ96QS3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARXQ96QS3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ARXQ96QS3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ARXQ96QS3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ARXQ96QS3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ARXQ96QS3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ARXQ96QS3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARXQ96QS3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ARXQ96QS3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARXQ96QS3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARXQ96QS3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ARXQ96QS3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARXQ96QS3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ARXQ96QS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARXQ96QS3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARXQ96QS3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARXQ96QS3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARXQ96QS3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ARXQ96QS3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARXQ96QS3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARXQ96QS3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARXQ96QS3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARXQ96QS3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
ARXQ96QS3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
ARXQ96QS3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ARXQ96QS3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARXQ96QS3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARXQ96QS3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARXQ96QS3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARXQ96QS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARXQ96QS3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ARXQ96QS3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARXQ96QS3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARXQ96QS3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ARXQ96QS3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARXQ96QS3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARXQ96QS3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ARXQ96QS3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARXQ96QS3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms