Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALPK1Q96QP1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK1Q96QP1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALPK1Q96QP1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALPK1Q96QP1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALPK1Q96QP1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALPK1Q96QP1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALPK1Q96QP1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ALPK1Q96QP1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALPK1Q96QP1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALPK1Q96QP1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALPK1Q96QP1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms