Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMG1Q96Q15 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMG1Q96Q15 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SMG1Q96Q15 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMG1Q96Q15 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMG1Q96Q15 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMG1Q96Q15 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG1Q96Q15 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMG1Q96Q15 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG1Q96Q15 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMG1Q96Q15 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMG1Q96Q15 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMG1Q96Q15 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMG1Q96Q15 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMG1Q96Q15 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG1Q96Q15 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMG1Q96Q15 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMG1Q96Q15 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMG1Q96Q15 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG1Q96Q15 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG1Q96Q15 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG1Q96Q15 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
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