Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CEP295NLQ96MC4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CEP295NLQ96MC4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CEP295NLQ96MC4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP295NLQ96MC4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CEP295NLQ96MC4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP295NLQ96MC4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CEP295NLQ96MC4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP295NLQ96MC4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP295NLQ96MC4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CEP295NLQ96MC4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CEP295NLQ96MC4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CEP295NLQ96MC4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CEP295NLQ96MC4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CEP295NLQ96MC4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CEP295NLQ96MC4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP295NLQ96MC4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CEP295NLQ96MC4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CEP295NLQ96MC4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CEP295NLQ96MC4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms