Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ALPK3Q96L96 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ALPK3Q96L96 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ALPK3Q96L96 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ALPK3Q96L96 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ALPK3Q96L96 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ALPK3Q96L96 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ALPK3Q96L96 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ALPK3Q96L96 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALPK3Q96L96 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ALPK3Q96L96 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ALPK3Q96L96 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ALPK3Q96L96 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ALPK3Q96L96 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ALPK3Q96L96 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ALPK3Q96L96 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALPK3Q96L96 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ALPK3Q96L96 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ALPK3Q96L96 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ALPK3Q96L96 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ALPK3Q96L96 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALPK3Q96L96 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ALPK3Q96L96 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ALPK3Q96L96 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALPK3Q96L96 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALPK3Q96L96 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ALPK3Q96L96 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ALPK3Q96L96 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms