Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EAF1Q96JC9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EAF1Q96JC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EAF1Q96JC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EAF1Q96JC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EAF1Q96JC9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EAF1Q96JC9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF1Q96JC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EAF1Q96JC9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms