Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPD52L3Q96J77 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPD52L3Q96J77 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPD52L3Q96J77 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPD52L3Q96J77 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPD52L3Q96J77 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPD52L3Q96J77 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPD52L3Q96J77 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPD52L3Q96J77 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPD52L3Q96J77 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPD52L3Q96J77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPD52L3Q96J77 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TPD52L3Q96J77 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TPD52L3Q96J77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TPD52L3Q96J77 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPD52L3Q96J77 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms