Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHDQ96IW2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SHDQ96IW2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SHDQ96IW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHDQ96IW2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHDQ96IW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHDQ96IW2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SHDQ96IW2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHDQ96IW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHDQ96IW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SHDQ96IW2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SHDQ96IW2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHDQ96IW2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHDQ96IW2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHDQ96IW2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHDQ96IW2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SHDQ96IW2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms