Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC35A4Q96G79 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35A4Q96G79 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35A4Q96G79 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC35A4Q96G79 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC35A4Q96G79 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC35A4Q96G79 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC35A4Q96G79 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC35A4Q96G79 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC35A4Q96G79 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC35A4Q96G79 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC35A4Q96G79 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC35A4Q96G79 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC35A4Q96G79 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC35A4Q96G79 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC35A4Q96G79 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC35A4Q96G79 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC35A4Q96G79 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC35A4Q96G79 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC35A4Q96G79 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC35A4Q96G79 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC35A4Q96G79 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms