Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED8Q96G25 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED8Q96G25 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED8Q96G25 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED8Q96G25 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED8Q96G25 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED8Q96G25 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED8Q96G25 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MED8Q96G25 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MED8Q96G25 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MED8Q96G25 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MED8Q96G25 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MED8Q96G25 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MED8Q96G25 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MED8Q96G25 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MED8Q96G25 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MED8Q96G25 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms