Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PERPQ96FX8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PERPQ96FX8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PERPQ96FX8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PERPQ96FX8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PERPQ96FX8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PERPQ96FX8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PERPQ96FX8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PERPQ96FX8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PERPQ96FX8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PERPQ96FX8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PERPQ96FX8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PERPQ96FX8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PERPQ96FX8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PERPQ96FX8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PERPQ96FX8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PERPQ96FX8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PERPQ96FX8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PERPQ96FX8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PERPQ96FX8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms