Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE2Q96FN4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE2Q96FN4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE2Q96FN4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE2Q96FN4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE2Q96FN4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE2Q96FN4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE2Q96FN4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms