Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MALSU1Q96EH3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MALSU1Q96EH3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MALSU1Q96EH3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALSU1Q96EH3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MALSU1Q96EH3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MALSU1Q96EH3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MALSU1Q96EH3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms