Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC39Q96DD0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC39Q96DD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC39Q96DD0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC39Q96DD0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC39Q96DD0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRC39Q96DD0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC39Q96DD0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC39Q96DD0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC39Q96DD0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC39Q96DD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC39Q96DD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms