Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RCN3Q96D15 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCN3Q96D15 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RCN3Q96D15 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCN3Q96D15 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCN3Q96D15 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RCN3Q96D15 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCN3Q96D15 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RCN3Q96D15 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RCN3Q96D15 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RCN3Q96D15 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCN3Q96D15 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RCN3Q96D15 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RCN3Q96D15 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RCN3Q96D15 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCN3Q96D15 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCN3Q96D15 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RCN3Q96D15 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RCN3Q96D15 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCN3Q96D15 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RCN3Q96D15 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RCN3Q96D15 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RCN3Q96D15 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RCN3Q96D15 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms