Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC38A4Q969I6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC38A4Q969I6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC38A4Q969I6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC38A4Q969I6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC38A4Q969I6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC38A4Q969I6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC38A4Q969I6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC38A4Q969I6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms