Protein–RNA interactions for Protein: Q92902

HPS1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1Q92902 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPS1Q92902 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPS1Q92902 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPS1Q92902 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPS1Q92902 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HPS1Q92902 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HPS1Q92902 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HPS1Q92902 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS1Q92902 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms