Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATAD2BQ8WXI9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATAD2BQ8WXI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATAD2BQ8WXI9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATAD2BQ8WXI9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATAD2BQ8WXI9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATAD2BQ8WXI9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATAD2BQ8WXI9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATAD2BQ8WXI9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATAD2BQ8WXI9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2BQ8WXI9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2BQ8WXI9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GATAD2BQ8WXI9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GATAD2BQ8WXI9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms