Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC44A1Q8WWI5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC44A1Q8WWI5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC44A1Q8WWI5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC44A1Q8WWI5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC44A1Q8WWI5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC44A1Q8WWI5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A1Q8WWI5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC44A1Q8WWI5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC44A1Q8WWI5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC44A1Q8WWI5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC44A1Q8WWI5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC44A1Q8WWI5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A1Q8WWI5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC44A1Q8WWI5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC44A1Q8WWI5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A1Q8WWI5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC44A1Q8WWI5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC44A1Q8WWI5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A1Q8WWI5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC44A1Q8WWI5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC44A1Q8WWI5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC44A1Q8WWI5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms