Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SVIPQ8NHG7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SVIPQ8NHG7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SVIPQ8NHG7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVIPQ8NHG7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SVIPQ8NHG7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SVIPQ8NHG7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms