Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KNL1Q8NG31 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KNL1Q8NG31 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KNL1Q8NG31 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KNL1Q8NG31 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KNL1Q8NG31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KNL1Q8NG31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNL1Q8NG31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KNL1Q8NG31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KNL1Q8NG31 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KNL1Q8NG31 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNL1Q8NG31 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KNL1Q8NG31 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KNL1Q8NG31 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms