Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PJA1Q8NG27 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PJA1Q8NG27 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PJA1Q8NG27 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PJA1Q8NG27 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PJA1Q8NG27 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PJA1Q8NG27 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PJA1Q8NG27 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PJA1Q8NG27 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PJA1Q8NG27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PJA1Q8NG27 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PJA1Q8NG27 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PJA1Q8NG27 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PJA1Q8NG27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PJA1Q8NG27 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PJA1Q8NG27 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PJA1Q8NG27 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PJA1Q8NG27 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PJA1Q8NG27 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms