Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL3Q8N8U3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTL3Q8N8U3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL3Q8N8U3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTL3Q8N8U3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTL3Q8N8U3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTL3Q8N8U3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL3Q8N8U3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTL3Q8N8U3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTL3Q8N8U3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL3Q8N8U3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTL3Q8N8U3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTL3Q8N8U3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTL3Q8N8U3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RTL3Q8N8U3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTL3Q8N8U3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTL3Q8N8U3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RTL3Q8N8U3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTL3Q8N8U3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTL3Q8N8U3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTL3Q8N8U3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTL3Q8N8U3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTL3Q8N8U3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL3Q8N8U3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTL3Q8N8U3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms