Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G2

VGLL2, Transcription cofactor vestigial-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL2Q8N8G2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
VGLL2Q8N8G2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
VGLL2Q8N8G2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
VGLL2Q8N8G2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
VGLL2Q8N8G2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
VGLL2Q8N8G2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
VGLL2Q8N8G2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
VGLL2Q8N8G2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
VGLL2Q8N8G2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
VGLL2Q8N8G2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VGLL2Q8N8G2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
VGLL2Q8N8G2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
VGLL2Q8N8G2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
VGLL2Q8N8G2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
VGLL2Q8N8G2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
VGLL2Q8N8G2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VGLL2Q8N8G2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
VGLL2Q8N8G2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
VGLL2Q8N8G2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VGLL2Q8N8G2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
VGLL2Q8N8G2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
VGLL2Q8N8G2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
VGLL2Q8N8G2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
VGLL2Q8N8G2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VGLL2Q8N8G2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
VGLL2Q8N8G2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
VGLL2Q8N8G2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
VGLL2Q8N8G2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
VGLL2Q8N8G2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
VGLL2Q8N8G2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
VGLL2Q8N8G2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
VGLL2Q8N8G2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
VGLL2Q8N8G2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
VGLL2Q8N8G2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
VGLL2Q8N8G2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
VGLL2Q8N8G2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms