Protein–RNA interactions for Protein: Q8N816

TMEM99, Transmembrane protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM99Q8N816 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM99Q8N816 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM99Q8N816 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM99Q8N816 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM99Q8N816 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM99Q8N816 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM99Q8N816 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM99Q8N816 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM99Q8N816 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM99Q8N816 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM99Q8N816 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM99Q8N816 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM99Q8N816 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM99Q8N816 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms