Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U6

EFHB, EF-hand domain-containing family member B, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHBQ8N7U6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFHBQ8N7U6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFHBQ8N7U6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFHBQ8N7U6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFHBQ8N7U6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EFHBQ8N7U6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFHBQ8N7U6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
EFHBQ8N7U6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EFHBQ8N7U6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
EFHBQ8N7U6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EFHBQ8N7U6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EFHBQ8N7U6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EFHBQ8N7U6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EFHBQ8N7U6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EFHBQ8N7U6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EFHBQ8N7U6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFHBQ8N7U6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFHBQ8N7U6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFHBQ8N7U6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFHBQ8N7U6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFHBQ8N7U6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFHBQ8N7U6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFHBQ8N7U6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFHBQ8N7U6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EFHBQ8N7U6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
EFHBQ8N7U6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
EFHBQ8N7U6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EFHBQ8N7U6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EFHBQ8N7U6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
EFHBQ8N7U6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EFHBQ8N7U6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms