Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NINQ8N4C6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NINQ8N4C6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NINQ8N4C6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NINQ8N4C6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NINQ8N4C6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NINQ8N4C6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NINQ8N4C6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINQ8N4C6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NINQ8N4C6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NINQ8N4C6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NINQ8N4C6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NINQ8N4C6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NINQ8N4C6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NINQ8N4C6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NINQ8N4C6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NINQ8N4C6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NINQ8N4C6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NINQ8N4C6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NINQ8N4C6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NINQ8N4C6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NINQ8N4C6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms