Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NDUFAF2Q8N183 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NDUFAF2Q8N183 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDUFAF2Q8N183 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NDUFAF2Q8N183 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NDUFAF2Q8N183 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NDUFAF2Q8N183 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NDUFAF2Q8N183 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NDUFAF2Q8N183 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDUFAF2Q8N183 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NDUFAF2Q8N183 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NDUFAF2Q8N183 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDUFAF2Q8N183 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NDUFAF2Q8N183 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDUFAF2Q8N183 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDUFAF2Q8N183 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDUFAF2Q8N183 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDUFAF2Q8N183 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms