Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM1Q8IZ96 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMTM1Q8IZ96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CMTM1Q8IZ96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CMTM1Q8IZ96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CMTM1Q8IZ96 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CMTM1Q8IZ96 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM1Q8IZ96 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM1Q8IZ96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms