Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPUSD2Q8IZ73 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPUSD2Q8IZ73 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RPUSD2Q8IZ73 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
RPUSD2Q8IZ73 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RPUSD2Q8IZ73 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RPUSD2Q8IZ73 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RPUSD2Q8IZ73 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPUSD2Q8IZ73 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RPUSD2Q8IZ73 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RPUSD2Q8IZ73 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RPUSD2Q8IZ73 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RPUSD2Q8IZ73 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPUSD2Q8IZ73 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RPUSD2Q8IZ73 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RPUSD2Q8IZ73 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
RPUSD2Q8IZ73 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPUSD2Q8IZ73 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPUSD2Q8IZ73 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPUSD2Q8IZ73 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPUSD2Q8IZ73 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPUSD2Q8IZ73 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RPUSD2Q8IZ73 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RPUSD2Q8IZ73 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RPUSD2Q8IZ73 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RPUSD2Q8IZ73 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RPUSD2Q8IZ73 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPUSD2Q8IZ73 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPUSD2Q8IZ73 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPUSD2Q8IZ73 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPUSD2Q8IZ73 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms