Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC13Q8IYE1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC13Q8IYE1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC13Q8IYE1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC13Q8IYE1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC13Q8IYE1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC13Q8IYE1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC13Q8IYE1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC13Q8IYE1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC13Q8IYE1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC13Q8IYE1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCDC13Q8IYE1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCDC13Q8IYE1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC13Q8IYE1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC13Q8IYE1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCDC13Q8IYE1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCDC13Q8IYE1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCDC13Q8IYE1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC13Q8IYE1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC13Q8IYE1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC13Q8IYE1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC13Q8IYE1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC13Q8IYE1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC13Q8IYE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms