Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXV7

KLHDC8B, Kelch domain-containing protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC8BQ8IXV7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KLHDC8BQ8IXV7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHDC8BQ8IXV7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KLHDC8BQ8IXV7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KLHDC8BQ8IXV7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KLHDC8BQ8IXV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KLHDC8BQ8IXV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KLHDC8BQ8IXV7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KLHDC8BQ8IXV7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KLHDC8BQ8IXV7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KLHDC8BQ8IXV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KLHDC8BQ8IXV7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC8BQ8IXV7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KLHDC8BQ8IXV7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KLHDC8BQ8IXV7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KLHDC8BQ8IXV7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC8BQ8IXV7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC8BQ8IXV7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KLHDC8BQ8IXV7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KLHDC8BQ8IXV7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHDC8BQ8IXV7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms