Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL7

MSRB3, Methionine-R-sulfoxide reductase B3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB3Q8IXL7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MSRB3Q8IXL7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSRB3Q8IXL7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSRB3Q8IXL7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MSRB3Q8IXL7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MSRB3Q8IXL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MSRB3Q8IXL7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSRB3Q8IXL7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSRB3Q8IXL7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms