Protein–RNA interactions for Protein: Q86YT6

MIB1, E3 ubiquitin-protein ligase MIB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB1Q86YT6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MIB1Q86YT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MIB1Q86YT6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIB1Q86YT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MIB1Q86YT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIB1Q86YT6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIB1Q86YT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MIB1Q86YT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MIB1Q86YT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MIB1Q86YT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MIB1Q86YT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MIB1Q86YT6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MIB1Q86YT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MIB1Q86YT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MIB1Q86YT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MIB1Q86YT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MIB1Q86YT6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms