Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VSIG1Q86XK7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VSIG1Q86XK7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG1Q86XK7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSIG1Q86XK7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSIG1Q86XK7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VSIG1Q86XK7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSIG1Q86XK7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG1Q86XK7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSIG1Q86XK7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSIG1Q86XK7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG1Q86XK7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSIG1Q86XK7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSIG1Q86XK7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG1Q86XK7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSIG1Q86XK7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSIG1Q86XK7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSIG1Q86XK7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSIG1Q86XK7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSIG1Q86XK7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSIG1Q86XK7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSIG1Q86XK7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSIG1Q86XK7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
VSIG1Q86XK7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
VSIG1Q86XK7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
VSIG1Q86XK7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VSIG1Q86XK7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
VSIG1Q86XK7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
VSIG1Q86XK7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
VSIG1Q86XK7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
VSIG1Q86XK7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
VSIG1Q86XK7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
VSIG1Q86XK7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VSIG1Q86XK7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VSIG1Q86XK7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
VSIG1Q86XK7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
VSIG1Q86XK7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms