Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM17Q86X19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM17Q86X19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM17Q86X19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM17Q86X19 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM17Q86X19 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM17Q86X19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM17Q86X19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM17Q86X19 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM17Q86X19 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms