Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SKAP1Q86WV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SKAP1Q86WV1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SKAP1Q86WV1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SKAP1Q86WV1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SKAP1Q86WV1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SKAP1Q86WV1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SKAP1Q86WV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SKAP1Q86WV1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SKAP1Q86WV1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SKAP1Q86WV1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SKAP1Q86WV1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SKAP1Q86WV1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SKAP1Q86WV1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SKAP1Q86WV1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SKAP1Q86WV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SKAP1Q86WV1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SKAP1Q86WV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SKAP1Q86WV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SKAP1Q86WV1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SKAP1Q86WV1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SKAP1Q86WV1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SKAP1Q86WV1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SKAP1Q86WV1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SKAP1Q86WV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SKAP1Q86WV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SKAP1Q86WV1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SKAP1Q86WV1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SKAP1Q86WV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SKAP1Q86WV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms