Protein–RNA interactions for Protein: Q86WS5

TMPRSS12, Transmembrane protease serine 12, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS12Q86WS5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMPRSS12Q86WS5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS12Q86WS5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS12Q86WS5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS12Q86WS5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS12Q86WS5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPRSS12Q86WS5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPRSS12Q86WS5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS12Q86WS5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS12Q86WS5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMPRSS12Q86WS5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMPRSS12Q86WS5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMPRSS12Q86WS5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMPRSS12Q86WS5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS12Q86WS5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TMPRSS12Q86WS5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS12Q86WS5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS12Q86WS5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMPRSS12Q86WS5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMPRSS12Q86WS5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms