Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFNEQ86WN2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFNEQ86WN2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNEQ86WN2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNEQ86WN2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFNEQ86WN2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFNEQ86WN2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFNEQ86WN2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IFNEQ86WN2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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