Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALYREFQ86V81 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALYREFQ86V81 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALYREFQ86V81 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ALYREFQ86V81 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ALYREFQ86V81 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALYREFQ86V81 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALYREFQ86V81 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALYREFQ86V81 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALYREFQ86V81 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALYREFQ86V81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALYREFQ86V81 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALYREFQ86V81 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALYREFQ86V81 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALYREFQ86V81 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ALYREFQ86V81 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALYREFQ86V81 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALYREFQ86V81 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ALYREFQ86V81 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALYREFQ86V81 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ALYREFQ86V81 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ALYREFQ86V81 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALYREFQ86V81 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms