Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SERPINA11Q86U17 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPINA11Q86U17 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SERPINA11Q86U17 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SERPINA11Q86U17 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SERPINA11Q86U17 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINA11Q86U17 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINA11Q86U17 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SERPINA11Q86U17 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SERPINA11Q86U17 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SERPINA11Q86U17 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SERPINA11Q86U17 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SERPINA11Q86U17 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SERPINA11Q86U17 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SERPINA11Q86U17 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SERPINA11Q86U17 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms