Protein–RNA interactions for Protein: Q7L985

LINGO2, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO2Q7L985 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINGO2Q7L985 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINGO2Q7L985 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINGO2Q7L985 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINGO2Q7L985 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO2Q7L985 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO2Q7L985 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINGO2Q7L985 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO2Q7L985 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms