Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LPCAT2Q7L5N7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LPCAT2Q7L5N7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LPCAT2Q7L5N7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPCAT2Q7L5N7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LPCAT2Q7L5N7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LPCAT2Q7L5N7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LPCAT2Q7L5N7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPCAT2Q7L5N7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LPCAT2Q7L5N7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LPCAT2Q7L5N7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LPCAT2Q7L5N7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LPCAT2Q7L5N7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
LPCAT2Q7L5N7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LPCAT2Q7L5N7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LPCAT2Q7L5N7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LPCAT2Q7L5N7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LPCAT2Q7L5N7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LPCAT2Q7L5N7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LPCAT2Q7L5N7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LPCAT2Q7L5N7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LPCAT2Q7L5N7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LPCAT2Q7L5N7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LPCAT2Q7L5N7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LPCAT2Q7L5N7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms