Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 423.2■■□□□ 1.32e-6■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-205ENST00000432449 566 ntTSL 523.19■■□□□ 1.38e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-211ENST00000467427 555 ntTSL 323.19■■□□□ 1.38e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.278e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ESPN-212ENST00000632593 506 ntTSL 222.76■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ANKRD13A-206ENST00000550404 2350 ntTSL 1 (best)22.74■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.158e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 TMC6-206ENST00000586271 970 ntTSL 221.7■■□□□ 1.068e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-213ENST00000470343 1026 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.978e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 CSNK1G2-209ENST00000591752 648 ntTSL 520.04■□□□□ 0.88e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 CSNK1G2-204ENST00000589350 780 ntTSL 520.02■□□□□ 0.88e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-221ENST00000577079 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.7■□□□□ 0.748e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.698e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-218ENST00000575736 566 ntTSL 519.31■□□□□ 0.688e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.638e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-220ENST00000576420 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.78■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-215ENST00000574953 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 518.25■□□□□ 0.518e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-204ENST00000570638 537 ntTSL 518.11■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-214ENST00000574722 586 ntTSL 418.11■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 318.07■□□□□ 0.488e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.488e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 SDC3-203ENST00000471567 589 ntTSL 317.85■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.438e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-216ENST00000543025 2522 ntTSL 1 (best)17.65■□□□□ 0.428e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 MAD1L1-208ENST00000437877 864 ntTSL 217.55■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.398e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 C21orf58-210ENST00000491666 1196 ntTSL 517.2■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 C21orf58-206ENST00000417060 1072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.2■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 517.17■□□□□ 0.348e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 417.14■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM6B-206ENST00000575521 219 ntTSL 517.1■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-214ENST00000542030 460 ntTSL 416.72■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.258e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 UCKL1-207ENST00000632800 1530 ntTSL 516.25■□□□□ 0.198e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 CSNK1G2-210ENST00000614707 249 ntTSL 216.12■□□□□ 0.178e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.168e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.158e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.098e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-203ENST00000446152 1549 ntTSL 515.44■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 315.41■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.078e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-209ENST00000538503 6676 ntTSL 514.12□□□□□ -0.158e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP11A-205ENST00000419448 435 ntTSL 313.71□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.238e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.278e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 SLC22A4-203ENST00000491257 564 ntTSL 413.09□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.338e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.358e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ANKRD13A-208ENST00000553025 1455 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.398e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 512.56□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 MIR647-201ENST00000384823 96 ntBASIC12.3□□□□□ -0.448e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.468e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-212ENST00000541318 600 ntTSL 411.6□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP11A-212ENST00000487903 8858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.678e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.728e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-208ENST00000538379 574 ntTSL 49.57□□□□□ -0.888e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.888e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 28.5□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 28.44□□□□□ -1.068e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 KDM2B-218ENST00000545022 544 ntTSL 47.69□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 52
DHX30Q7L2E3 LNX1-207ENST00000511398 622 ntTSL 410.41□□□□□ -0.745e-9■■■■■ 51.7
DHX30Q7L2E3 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.915e-9■■■■■ 51.7
DHX30Q7L2E3 LNX1-202ENST00000306888 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.055e-9■■■■■ 51.7
DHX30Q7L2E3 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 51.4
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-225ENST00000489897 998 ntTSL 522.52■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.993e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-230ENST00000530154 1670 ntTSL 221.09■□□□□ 0.973e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.763e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-202ENST00000330208 1479 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-210ENST00000361746 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-215ENST00000372367 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-229ENST00000528371 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-217ENST00000372369 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-231ENST00000530581 893 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 50.9
DHX30Q7L2E3 ST3GAL3-203ENST00000332628 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 50.9
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 30.9 ms