RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318160.4

GREM2-201, Transcript of gremlin 2, DAN family BMP antagonist, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GREM2, Length 4,170 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM2-201ENST00000318160 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.4■■□□□ 1.82
GREM2-201ENST00000318160 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.28■■□□□ 1.32
GREM2-201ENST00000318160 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.01■■□□□ 1.27
GREM2-201ENST00000318160 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
GREM2-201ENST00000318160 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.32■■□□□ 1.16
GREM2-201ENST00000318160 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
GREM2-201ENST00000318160 ABCC9O60706 1549 aa21.64■■□□□ 1.05
GREM2-201ENST00000318160 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.44■■□□□ 1.02
GREM2-201ENST00000318160 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.4■■□□□ 1.02
GREM2-201ENST00000318160 SCRIBQ14160 1630 aa21.27■■□□□ 1
GREM2-201ENST00000318160 TRIM41Q8WV44 630 aa21.1■□□□□ 0.97
GREM2-201ENST00000318160 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
GREM2-201ENST00000318160 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.05■□□□□ 0.96
GREM2-201ENST00000318160 NACADO15069 1562 aa21.01■□□□□ 0.95
GREM2-201ENST00000318160 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.92■□□□□ 0.94
GREM2-201ENST00000318160 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.89■□□□□ 0.94
GREM2-201ENST00000318160 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
GREM2-201ENST00000318160 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.87■□□□□ 0.93
GREM2-201ENST00000318160 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa20.85■□□□□ 0.93
GREM2-201ENST00000318160 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.82■□□□□ 0.92
GREM2-201ENST00000318160 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.66■□□□□ 0.9
GREM2-201ENST00000318160 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.49■□□□□ 0.87
GREM2-201ENST00000318160 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
GREM2-201ENST00000318160 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
GREM2-201ENST00000318160 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GREM2-201ENST00000318160 HRCP23327 699 aa20.3■□□□□ 0.84
GREM2-201ENST00000318160 WIZO95785 1651 aa20.29■□□□□ 0.84
GREM2-201ENST00000318160 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
GREM2-201ENST00000318160 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
GREM2-201ENST00000318160 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GREM2-201ENST00000318160 APLP2Q06481 763 aa20.12■□□□□ 0.81
GREM2-201ENST00000318160 SMARCA4P51532 1647 aa20.09■□□□□ 0.81
GREM2-201ENST00000318160 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.07■□□□□ 0.8
GREM2-201ENST00000318160 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GREM2-201ENST00000318160 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.04■□□□□ 0.8
GREM2-201ENST00000318160 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
GREM2-201ENST00000318160 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
GREM2-201ENST00000318160 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
GREM2-201ENST00000318160 ABCC8Q09428 1581 aa19.9■□□□□ 0.78
GREM2-201ENST00000318160 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.77
GREM2-201ENST00000318160 SMARCA2P51531 1590 aa19.83■□□□□ 0.77
GREM2-201ENST00000318160 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.82■□□□□ 0.76
GREM2-201ENST00000318160 UNC13AQ9UPW8 1703 aa19.81■□□□□ 0.76
GREM2-201ENST00000318160 BICRAQ9NZM4 1560 aa19.81■□□□□ 0.76
GREM2-201ENST00000318160 SOGA1O94964 1423 aa19.78■□□□□ 0.76
GREM2-201ENST00000318160 EEA1Q15075 1411 aa19.78■□□□□ 0.76
GREM2-201ENST00000318160 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.69■□□□□ 0.74
GREM2-201ENST00000318160 CEP162Q5TB80 1403 aa19.67■□□□□ 0.74
GREM2-201ENST00000318160 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.64■□□□□ 0.74
GREM2-201ENST00000318160 GOLGA3Q08378 1498 aa19.64■□□□□ 0.73
GREM2-201ENST00000318160 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
GREM2-201ENST00000318160 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
GREM2-201ENST00000318160 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.55■□□□□ 0.72
GREM2-201ENST00000318160 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.54■□□□□ 0.72
GREM2-201ENST00000318160 CLIP1P30622 1438 aa19.52■□□□□ 0.72
GREM2-201ENST00000318160 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
GREM2-201ENST00000318160 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.46■□□□□ 0.71
GREM2-201ENST00000318160 NCAPD3P42695 1498 aa19.46■□□□□ 0.71
GREM2-201ENST00000318160 KIF27Q86VH2 1401 aa19.41■□□□□ 0.7
GREM2-201ENST00000318160 ITGAEP38570 1179 aa19.39■□□□□ 0.69
GREM2-201ENST00000318160 SYNJ1O43426 1573 aa19.35■□□□□ 0.69
GREM2-201ENST00000318160 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.32■□□□□ 0.68
GREM2-201ENST00000318160 P3H3Q8IVL6 736 aa19.31■□□□□ 0.68
GREM2-201ENST00000318160 HMGXB3Q12766 1538 aa19.3■□□□□ 0.68
GREM2-201ENST00000318160 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.29■□□□□ 0.68
GREM2-201ENST00000318160 CUX2O14529 1486 aa19.25■□□□□ 0.67
GREM2-201ENST00000318160 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.21■□□□□ 0.67
GREM2-201ENST00000318160 CFTRP13569 1480 aa19.21■□□□□ 0.67
GREM2-201ENST00000318160 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
GREM2-201ENST00000318160 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.15■□□□□ 0.66
GREM2-201ENST00000318160 TOP2BQ02880 1626 aa19.15■□□□□ 0.66
GREM2-201ENST00000318160 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
GREM2-201ENST00000318160 KIF21BO75037 1637 aa19.11■□□□□ 0.65
GREM2-201ENST00000318160 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.09■□□□□ 0.65
GREM2-201ENST00000318160 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.09■□□□□ 0.65
GREM2-201ENST00000318160 CUX1P39880 1505 aa19.09■□□□□ 0.65
GREM2-201ENST00000318160 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
GREM2-201ENST00000318160 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.02■□□□□ 0.64
GREM2-201ENST00000318160 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
GREM2-201ENST00000318160 IGF1RP08069 1367 aa19■□□□□ 0.63
GREM2-201ENST00000318160 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
GREM2-201ENST00000318160 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.98■□□□□ 0.63
GREM2-201ENST00000318160 PRXQ9BXM0 1461 aa18.98■□□□□ 0.63
GREM2-201ENST00000318160 ERICH3Q5RHP9 1530 aa18.95■□□□□ 0.62
GREM2-201ENST00000318160 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
GREM2-201ENST00000318160 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
GREM2-201ENST00000318160 FBLN2P98095 1184 aa18.93■□□□□ 0.62
GREM2-201ENST00000318160 NESP48681 1621 aa18.92■□□□□ 0.62
GREM2-201ENST00000318160 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.92■□□□□ 0.62
GREM2-201ENST00000318160 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18.9■□□□□ 0.62
GREM2-201ENST00000318160 ARID3CA6NKF2 412 aa18.9■□□□□ 0.62
GREM2-201ENST00000318160 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.88■□□□□ 0.61
GREM2-201ENST00000318160 NEUROD1Q13562 356 aa18.85■□□□□ 0.61
GREM2-201ENST00000318160 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.84■□□□□ 0.61
GREM2-201ENST00000318160 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.84■□□□□ 0.61
GREM2-201ENST00000318160 ARAP1Q96P48 1450 aa18.82■□□□□ 0.6
GREM2-201ENST00000318160 DNAJC5BQ9UF47 199 aa18.8■□□□□ 0.6
GREM2-201ENST00000318160 TOPBP1Q92547 1522 aa18.79■□□□□ 0.6
GREM2-201ENST00000318160 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.77■□□□□ 0.6
GREM2-201ENST00000318160 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms