Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC80Q76M96 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC80Q76M96 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC80Q76M96 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC80Q76M96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC80Q76M96 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC80Q76M96 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC80Q76M96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC80Q76M96 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC80Q76M96 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC80Q76M96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC80Q76M96 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC80Q76M96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC80Q76M96 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC80Q76M96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms